首都儿科研究所是一所以医学基础研究、儿科疾病发病机理研究、儿童保健为重点,承担有医疗、教学和预防任务的应用医学研究机构。其前身是中国医学科学院儿科研究所 ,成立于1958年,是新中国第一家儿科医学研究所。于1983年隶属北京市,1984年开设门诊,1986年建立附属儿童医院。1993年,在京郊顺义区组建“北京市医用生物制品中试基地”。
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